分居两年离婚的程序主要分为两种方式：协议离婚和诉讼离婚。
协议离婚
双方需签订书面离婚协议，明确子女抚养、财产及债务处理等事项。
携带身份证、户口本、结婚证、离婚协议到婚姻登记机关申请离婚登记。
经过30天冷静期后，双方再次前往婚姻登记机关领取离婚证。
诉讼离婚
一方向法院提交离婚起诉书及相关证据，如分居协议、租赁合同、往来信函、居委会证明等，以证明因感情不和分居满两年。
法院在审理离婚案件时会进行调解，若调解无效且分居满两年，确认感情破裂，判决准予离婚。
建议
协议离婚：适用于双方均同意离婚且能就相关事项达成一致的情况，较为快速和平。
诉讼离婚：适用于一方不同意离婚或双方无法就离婚事项达成一致的情况，需要经过法院审理和调解，可能较为复杂和漫长。
无论选择哪种方式，都需要遵循法律程序，确保公正合法。在分居满两年后，建议先尝试协议离婚，若无法达成一致，再向法院提起离婚诉讼。
