分立公司之所以困难，主要原因可以归纳为以下几点：
程序上的缺陷或漏洞
公司分立必须遵守严格的程序要求，包括编制资产负债表及财产清单、通知债权人并进行公告等。如果这些程序上存在缺陷或漏洞，将会直接导致公司分立的有效性受到质疑和挑战。
利益分配不公
如果在分立过程中涉及到的利益分配或其他方面存在明显的不公现象，同样可能导致公司分立无效。例如，换股比例不公平或分立有关书类的内容违反强行法规等。
法律依据不足
公司分立涉及到权利和义务的转移，必须符合《中华人民共和国公司法》等相关法律法规的规定。如果分立操作不符合法律要求，可能导致分立无效。
债权债务复杂
带资质分立的公司，债权债务复杂，难以厘清明确。在资质分立结束后，可能会出现多余的债务需要承担，增加了分立的难度和不确定性。
地方政策限制
某些地区可能会出于税收、经济等方面的考量，限制资质分立。例如，在办理变更手续时可能会出现各种证明材料要求，影响资质分立的顺利进行。
证件不齐全
转让资质的材料不全，出现问题的可能性很大，对最终的审核结果会有很大影响。企业在选择公司时，要避免证件有效期过短或存在问题的资质。
存在在建项目
如果建筑资质分立时，企业存在在建项目，是无法办理转让手续的。此外，如果存在工程事故记录，日后办理资质升级也会受到影响。
综上所述，分立公司之所以困难，主要是因为程序上的严格要求、利益分配的不公、法律依据的不足、债权债务的复杂性、地方政策的限制、证件的不齐全以及存在在建项目等多方面因素的影响。因此，在进行公司分立时，企业需要充分考虑这些因素，确保分立过程的合法性和有效性。
