通过传真方式签订协议，可以参照以下步骤进行：
扫描合同并传输
一方将需要签署的合同扫描成电子版，并通过电话传输给对方。
对方签订并回传
接收方收到合同后，在合同上签名或盖章，并通过传真将签署后的合同回传给发送方。
双方确认
发送方收到回传签名的合同后，进行最终的确认，确保合同内容无误。
保留证据
双方应收集并保留所有相关的证据，如传真件、信函、电话录音、电子邮件等，以证明合同是通过传真方式签订的。
补签书面确认书
如果双方同意，可以通过信函邮寄一份书面确认书，明确双方通过传真方式签订合同的事实，并确认合同的内容和条款。
确定签订地
根据《中华人民共和国民法典》第四百九十二条，如果合同有约定的签订地点，则按照约定执行；如果没有约定，则以收件人的主营业地为合同签订地，若没有主营业地，则为收件人的住所地。
通过以上步骤，双方可以完成通过传真的方式签订协议，并确保合同的合法性和有效性。
